91 核心文件索引
这份索引的目标不是罗列全部目录，而是给你一张“源码地图入口”：当你想沿着业务流追代码、或在脑中重新定位某个名词时，优先从这里挑一个锚点文件切入。
推荐用法：
- 顺读主线：先走“入口层 → 主循环层 → 工具系统层”，再按需补“扩展系统层/远程与协同层”。
- 反查名词：在本索引里找到该名词所在层的锚点文件，然后用
rg追踪引用扩散。
章节对照：Part 1 的前三章分别对应入口分流、初始化边界、会话上下文与消息模型，可配合阅读：
入口层（EntryPoints）
restored-src/src/entrypoints/cli.tsx：CLI bootstrap + 模式分流（fast-path、bridge/daemon/bg sessions、常规交互入口）。restored-src/src/entrypoints/init.ts：昂贵初始化边界（配置、环境变量注入、网络代理与 TLS、清理器、遥测等“主会话前置基础设施”）。restored-src/src/main.tsx：完整 CLI 主模块（命令解析、交互会话启动、把入口接入主循环与 UI）。
主循环层（Query Loop）
restored-src/src/query.ts：一次请求的主循环（流式生成、识别 tool_use、执行工具并回填 tool_result、直到收束）。restored-src/src/query/stopHooks.ts：停止与收尾钩子（决定何时 stop/continue，以及终止路径上的收口动作）。restored-src/src/query/tokenBudget.ts：token 预算与恢复策略（把主循环变成“可治理的循环”，而不是无限推进）。restored-src/src/utils/messages.ts：消息构造与规范化边界（本地消息形态与发往 API 的消息形态在这里收敛）。
工具系统层（Tools System）
restored-src/src/Tool.ts：工具协议与ToolUseContext（贯穿主循环与工具执行的“上下文容器”，也是治理与扩展的挂载点）。restored-src/src/services/tools/toolOrchestration.ts：工具编排策略（并发安全分批、上下文变更应用顺序、执行阶段如何产出增量消息）。restored-src/src/services/tools/toolExecution.ts：单工具执行包装（把执行结果编码为可回填的tool_result消息，并覆盖取消/错误路径）。restored-src/src/services/tools/StreamingToolExecutor.ts：流式工具执行器（在工具执行阶段保持“可流式消费”的事件节奏）。
扩展系统层（Skills / Plugins / MCP）
restored-src/src/skills/loadSkillsDir.ts：Skills 发现与加载（把“方法论/固定流程”变成可注入的可执行资产）。restored-src/src/skills/bundledSkills.ts：内置 skills 注册（把官方/随包 skills 组织成可用集合，并与上下文衔接）。restored-src/src/plugins/builtinPlugins.ts：内置插件集合（把插件作为扩展单元纳入系统生命周期）。restored-src/src/services/mcp/client.ts：MCP 客户端与协议交互（外部工具/资源如何接入到同一套工具与上下文模型里）。
远程与协同层（Remote / Bridge / Tasks）
restored-src/src/bridge/bridgeMain.ts：bridge 运行形态入口（把本机作为可被远程调度的环境，并落地鉴权/策略）。restored-src/src/bridge/remoteBridgeCore.ts：bridge 核心逻辑（连接生命周期、消息桥接、远程请求如何进入本地执行闭环）。restored-src/src/remote/RemoteSessionManager.ts：远程会话管理（远程 session 的创建、维护与状态同步入口）。restored-src/src/tasks/LocalMainSessionTask.ts：任务托管形态之一（把“会话/执行”包装成可调度任务，适配后台/协同场景）。restored-src/src/coordinator/coordinatorMode.ts：协同模式入口（多代理/协作执行的模式组织与开关点）。